AI设计的噬菌体第一次用在病人身上

一位感染了耐药大肠杆菌的病人，接受了一组噬菌体鸡尾酒治疗。特别的地方在于，其中几株噬菌体是 AI 设计的。

设计它们的模型叫 Omnii-1，是 Radical Numerics 开发的多模态基因组语言模型。

先补一点背景。噬菌体是专门感染细菌的病毒，杀细菌但不碰人体细胞，抗生素失效的时候，它是少数还能指望的办法之一。麻烦在于每种噬菌体只认很窄的几类菌株，找到合适的一般要去现有的噬菌体库里一株株筛。库里没有对得上的，就只能动手改造。

这次团队用的是研究得很透的 T7 噬菌体。它有六根尾丝，像小腿一样，负责认出细菌、抓住细菌表面，然后把自己的 DNA 注进去。细菌被迫生产新病毒，最后胀破，放出一批新的噬菌体。

研究人员让 Omnii-1 去改 gp17，也就是编码 T7 尾丝受体结合蛋白的那个基因。

难点在于平衡。改了尾丝，噬菌体能认的细菌就变了，这是想要的；但基因组一动，感染和复制那套机制也可能被破坏，改出来的病毒可能根本活不了。

Omnii-1 的做法是参考周围的基因组上下文来生成序列，尽量保住病毒的存活能力。团队把生成的变体合成出来，拿去对各种菌株测活性。结果含有 Omnii-1 设计变体的鸡尾酒，在实验室里清除了这位病人身上分离出来的耐药菌，随后才用到了病人身上。

个案离成熟疗法还很远，疗效和安全性都需要更多病例来验证。但它说明了一件事：当现成的库里找不到药的时候，AI 已经可以帮着“现场设计”一个。对越来越多的耐药菌感染来说，这条路值得盯着。